Попов А.И. Программная библиотека для работы с исследовательскими хранилищами данных электрофизиологических исследований моторики ЖКТ // Материалы XXIII Объединенной Российской Гастронедели. РЖГГК. 2017. Т.XXVII. № 5. прил. 50. C. 103.

Программная библиотека для работы с исследовательскими хранилищами данных электрофизиологических исследований моторики желудочно-кишечного тракта

Попов А.И.

Северный (Арктический) федеральный университет им. М.Б. Ломоносова, Архангельск, Россия

Цель исследования: совершенствование технологической базы электрогастрографии (ЭГГ) и электрогастроэнтерографии (ЭГЭГ).

Материалы и методы. Аналитический обзор научных публикаций; обобщение; методы моделирования данных; методы проектирования программного обеспечения; методы программирования.

Результаты. Проведен обзор актуальных публикаций, посвященных статистической обработке результатов ЭГГ/ЭГЭГ-обследований, на предмет строения исследовательских данных. Получена обобщающая концептуальная модель данных «Сигнал - Измерение - Обследование» (SME), покрывающая потребности проводимых исследований с массивами измерительных данных. Предложена гибкая архитектура программной библиотеки для работы с исследовательскими хранилищами материалов ЭГГ/ЭГЭГ-обследований, в том числе для формирования статистических выборок. Данная архитектура в целом соответствует паттерну Model-View-Controller (МVC). Программная библиотека реализована в виде свободного Python3-пакета EGEGrouper. Особенностью EGEGrouper является расширяемый набор средств импорта SМЕ-конструкций в хранилище из разнотипных источников данных. EGEGrouper может использоваться как в качестве встраиваемой библиотеки подпрограмм, так и непосредственно конечным пользователем - исследователем, занятым подготовкой статистических выборок.

Выводы. В современных прикладных исследованиях в области ЭГГ и ЭГЭГ, как правило, применяется статистическая обработка массивов измерительных данных. При этом экспериментальные данные «замкнуты» в рамках используемых технологий. Отсутствует открытое общедоступное хранилище исследовательских данных ЭГГ и ЭГЭГ. Используемые в современных исследованиях структуры данных, протоколы обследования, обобщаются концептуальной моделью SME. В данной работе предложена основанная на МVC архитектура программной библиотеки для работы с группами обследований. Получена ее программная реализация.